Informace o projektu
Rostlinné transpozony a konformace DNA
Kód projektu | GA15-02891S CEP CORDIS MU WEB INET MU |
---|---|
Doba řešení | 01.01.2015–31.12.2017 |
Stav | ukončený |
Investor | Grantová agentura ČR |
Program | Standardní projekty |
Řešitel za FI |
Anotace
Transpozony jsou významnou součástí rostlinných genomů ovlivňující jejich fungování i evoluci. U některých druhů tvoří až 90% genomu. Transpozony obsahují důležité regulační oblasti, o nichž bylo nedávno zjištěno, že obsahují sekvence schopné tvořit vícevláknové konformace DNA - kvadruplexy a triplexy. V rámci navrhovaného projektu budeme podrobně studovat výskyt kvadruplexů v hlavních rodinách transpozonů (u LTR- a nonLTR retrotranspozonů) u osekvenovaných druhů rostlin. Schopnost vybraných sekvencí tvořit kvadruplexy budeme ověřovat pomocí cirkulárního dichroismu. V kvasinkách a poté i v Arabidopsis thaliana budeme sledovat vliv transpozonových kvadruplexů na expresi reportérového genu a na aktivitu transpozonů. Protože kvadruplexy a triplexy ovlivňují rekombinaci DNA, budeme sledovat jak jejich výskyt v transpozonech souvisí s umístěním transpozonů v genomu, zejména v oblastech se sníženou rekombinací nebo bez rekombinace (například chromosom Y). Naše výsledky přispějí k pochopení úlohy neobvyklých konformací DNA v životním cyklu transpozonů i jejich dopadu na rostlinný genom.