Hlavičkové soubory pro C (C header Files) - v include - představují podporu pro psaní tzv. nativních metod přímo v jazyce C.
Staré hlavičkové soubory (Old Native Interface Headers) - totéž, ale pro starší verzi rozhraní.
Zdrojový kód (Source Code) knihoven z Java Core API se nalézá v archivu src.jar.
Dokumentace (Documentation) - v podadresáři docs - obsahuje dokumentaci k dané verzi JDK, k API, nejrůznější průvodce vývojem, dokumentaci k nástrojům, ukázkové programy a odkazy na související dokumentaci.