Impaktované časopisy          Konference          Celkem

Podklady pro hodnocení kateder na základě článků v impaktovaných časopisech ohodnocených podle pozice časopisu v oborovém žebříčku dle JCR, konferenčních příspěvků ohodnocených dle interních pravidel a „RIV“ bodů Hodnocení 2016. Jde o výsledky vykázané za FI nebo s deklarovaným podílem FI (konkrétní výše podílu není nijak zohledněna).

Hodnoty výsledků dělím rovným dílem mezi domácí autory s vazbou k jedné z kateder. Základem pro rozřazení autorů ke katedrám je seznam zaměstnanců kateder. Doktorandi jsou řazeni na katedru svého školitele, ze zbylých domácích autorů jsou ti, kteří mají spoluautory pouze z jedné katedry, zařazeni na tuto katedru, z ostatních jsou ti s významnějším přínosem zařazeni ručně (např. magisterští studenti dle vedoucího DP), podíl těch s marginálním přínosem je rozdělen mezi jejich spoluautory.

Šafránek David (IS), katedra: KSUZD, zdroj vazby: seznam

Články v impaktovaných časopisech dle IS MU 2013–2017 (celkem 0.375)

Hodnota se počítá jako (Nmax - N + 1) / N, kde Nmax je počet časopisů v kategorii a N pořadí časopisu dle IF. Při zařazení časopisu do více kategorií nebo shodě IF se bere průměr. Najetím myší na hodnotu se zobrazí pořadí v oborových žebříčcích daného ročníku JCR (pro 2017 JCR2016; JCR2017 ještě nevyšlo), odkaz vede na stránku časopisu v JCR (oborové žebříčky tam jsou pod odkazem Rank), funguje ale jen z IP adres MU a je potřeba kliknout alespoň dvakrát, první přístup pouze inicializuje session.

hodnotadíl autoraroktitlezapočítaníostatní
0.860.2152014Robustness Analysis of Stochastic Biochemical Systems (DOI)Češka, Šafránek, Dražan, Brim
0.480.162014STL*: Extending signal temporal logic with signal-value freezing operator (DOI)Brim, Šafránek, VejpustekDluhoš

Články ve sbornících dle IS MU 2013–2017 (celkem A*: 0.45, A: 0.4, B: 0.543, C: 3.7, D: 1) Popis rankingu viz zde.
rankroktitlezapočítaníostatnínakladatelsborník
A*2017Pithya: A Parallel Tool for Parameter Synthesis of Piecewise Multi-Affine Dynamical Systems (DOI)Beneš, Brim, Demko, Pastva, ŠafránekSpringer International PublishingComputer Aided Verification. CAV 2017
A*2013Exploring Parameter Space of Stochastic Biochemical Systems Using Quantitative Model Checking (DOI)Brim, Češka, Dražan, ŠafránekSpringer Berlin Heidelberg25th International Conference, CAV 2013, Saint Petersburg, Russia, July 13-19, 2013. Proceedings
A2016Parallel SMT-Based Parameter Synthesis with Application to Piecewise Multi-Affine Systems (DOI)Beneš, Brim, Demko, Pastva, ŠafránekSpringer International PublishingAutomated Technology for Verification and Analysis. ATVA 2016
A2016A Model Checking Approach to Discrete Bifurcation Analysis (DOI)Beneš, Brim, Demko, Pastva, ŠafránekSpringer International PublishingFormal Methods. FM 2016
B2017Detecting Attractors in Biological Models with Uncertain Parameters (DOI)Brim, Barnat, Šafránek, Beneš, Demko, Pastva, HajnalSpringer International PublishingComputational Methods in Systems Biology. CMSB 2017
B2016High-Performance Symbolic Parameter Synthesis of Biological Models: A Case Study (DOI)Demko, Beneš, Brim, Pastva, ŠafránekSpringer International PublishingComputational Methods in Systems Biology. CMSB 2016.
B2015Parameter Synthesis by Parallel Coloured CTL Model Checking (DOI)Brim, Češka, Demko, Pastva, ŠafránekSpringer International PublishingComputational Methods in Systems Biology
C2016Toward Modelling and Analysis of Transient and Sustained Behaviour of Signalling Pathways (DOI)Hajnal, Šafránek, Demko, Pastva, BrimKrejčíSpringer International PublishingHybrid Systems Biology. HSB 2016
C2016E-Cyanobacterium.org: A Web-Based Platform for Systems Biology of Cyanobacteria (DOI)Troják, ŠafránekHrabec, Šalagovič, Romanovská, ČervenýSpringerComputational Methods in Systems Biology. CMSB 2016.
C2016Formal Biochemical Space with Semantics in Kappa and BNGL (DOI)Šafránek, Troják, Klement, BrimDěd, ŠalagovičElsevierThe 6th International Workshop on Static Analysis and Systems Biology, SASB 2015
C2015Compact Representation of Photosynthesis Dynamics by Rule-based Models (DOI)Brim, Nižnan, ŠafránekElsevier5th International Workshop on Static Analysis and Systems Biology (SASB 2014)
C2015High-Performance Discrete Bifurcation Analysis for Piecewise-Affine Dynamical Systems (DOI)Brim, Demko, Pastva, ŠafránekSpringer International PublishingHybrid Systems Biology Fourth International Workshop, HSB 2015, Madrid, Spain, September 4-5, 2015. Revised Selected Papers
C2014Biochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models (DOI)Klement, ŠafránekDěd, Červený, Mueller, SteuerElsevierProceedings of the 5th International Workshop on Interactions between Computer Science and Biology (CS2Bio’14)
C2013Timed Modelling of Gene Networks with Arbitrary Expression Level Discretization (DOI)Brim, ŠafránekVan, JacquetElsevierProceedings of the Third International Workshop on Interactions Between Computer Science and Biology (CS2Bio'12)
C2013A Comprehensive Web-based Platform For Domain-Specific Biological Models (DOI)Klement, ŠafránekDěd, Pejznoch, Nedbal, Steuer, Červený, MuellerElsevierProceedings of the fourth International Workshop on Interactions between Computer Science and Biology (CS2Bio'13)
C2013Model Checking of Biological Systems (DOI)Brim, Češka, ŠafránekSpringerFormal Methods for Dynamical Systems
C2013Esther: Introducing an Online Platform for Parameter Identification of Boolean NetworksStreck, Kolčák, ŠafránekSiebertSpringerComputational Methods in Systems Biology 11th International Conference, CMSB 2013, Klosterneuburg, Austria, September 22-24, 2013, Proceedings
D2013Qualitative modelling and analysis of Photosystem IIBrim, ŠafránekDědNeuvedenCEUR Workshop Proceedings
D2013Robustness Analysis for Value-Freezing Signal Temporal Logic (DOI)Brim, Vejpustek, Šafránek, DražanováNeuvedenProceedings HSB 2013
D2013Robustness Analysis of Stochastic Systems (DOI)Brim, Češka, Dražan, ŠafránekOpen Publishing AssociationElectronic Proceedings in Theoretical Computer Science, Volume 116

Body v RIVu dle Hodnocení 2016 (tedy 2011–2015; celkem 83.218)

Z Hodnocení jsou převzaty body za publikační výsledky z Pilíře I, body za aplikované výsledky (SW, druh R) z roku 2011 z Pilíře III a body za projekty aplikovaného výzkumu z Pilíře III, které jsou vždy přiděleny vedoucím těchto projektů (p.t. Horák, Matyáš, Pala, Přenosil a Zezula, z pohledu dělení na katedry postačující, z individuálního pohledu to pochopitelně čísla trochu zkresluje). Případné procentní podíly pracovišť v IS MU nejsou zohledněny (stran přerozdělení mezi fakultami jde o malé desítky bodů, ale bylo by obtížné to korektně dohledat, stran rozdělení mezi katedry jsou data neúplná a/nebo nespolehlivá).

body FIbody autorarokzařazení :druhtitlezapočítaníostatní
65.23616.3092014Jimp:JRobustness Analysis of Stochastic Biochemical Systems (DOI)Češka, Šafránek, Dražan, Brim
34.428.6052012D:DOn Approximative Reachability Analysis of Biochemical Dynamical Systems (DOI)Brim, Dražanová, Dražan, Šafránek
31.646.3282012Jimp:JOn Parameter Synthesis by Parallel Model Checking (DOI)Barnat, Brim, Streck, Šafránek, VejpustekKrejčí, Vejnár
25.8158.6052012D:DParameter Identification and Model Ranking of Thomas Networks (DOI)Streck, Šafránek, Kolčák
23.1415.7852013D:DExploring Parameter Space of Stochastic Biochemical Systems Using Quantitative Model Checking (DOI)Brim, Češka, Dražan, Šafránek
23.1417.7142013D:DModel Checking of Biological Systems (DOI)Brim, Češka, Šafránek
19.9956.6652014Jimp:JSTL*: Extending signal temporal logic with signal-value freezing operator (DOI)Brim, Šafránek, VejpustekDluhoš
19.8356.6122013D:DEsther: Introducing an Online Platform for Parameter Identification of Boolean NetworksStreck, Kolčák, Šafránek
19.354.8382011Jimp:JE-photosynthesis: Web-based platform for modeling of complex photosynthetic processes (DOI)Šafránek, Klement, Pospíšilová, Brim
15.7363.9342015D:DHigh-Performance Discrete Bifurcation Analysis for Piecewise-Affine Dynamical Systems (DOI)Brim, Demko, Pastva, Šafránek
15.7363.1472015D:DParameter Synthesis by Parallel Coloured CTL Model Checking (DOI)Brim, Češka, Demko, Pastva, Šafránek
4.0092.0042013D:DQualitative modelling and analysis of Photosystem IIBrim, ŠafránekDěd
2.6721.3362013D:DA Comprehensive Web-based Platform For Domain-Specific Biological Models (DOI)Klement, ŠafránekDěd, Pejznoch
2.6721.3362013D:DTimed Modelling of Gene Networks with Arbitrary Expression Level Discretization (DOI)Brim, Šafránek
002015neu:DCompact Representation of Photosynthesis Dynamics by Rule-based Models (DOI)Brim, Nižnan, Šafránek
002014neu:DBiochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models (DOI)Klement, ŠafránekDěd
002013neu:DRobustness Analysis for Value-Freezing Signal Temporal Logic (DOI)Brim, Vejpustek, Šafránek, Dražanová
002013neu:DRobustness Analysis of Stochastic Systems (DOI)Brim, Češka, Dražan, Šafránek
002012neu:JOn Expressing and Monitoring Oscillatory Dynamics (DOI)Brim, ŠafránekDluhoš
002011neu:DAbstraction of Biochemical Reaction Systems on PolytopesČerná, Dražanová, Šafránek
002011neu:JReachability in Biochemical Dynamical Systems by Quantitative Discrete Approximation (DOI)Brim, Dražanová, Dražan, Šafránek