Doctoral Study Graduates in 2011

RNDr. Barbora Kozlíková

Field of StudyInformatics
Doctoral Thesis Visualization Techniques for Static and Dynamic Protein Molecules and Their Channels
Supervisor doc. Ing. Jiří Sochor, CSc., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU (Chairman)
prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., FI MU
doc. RNDr. Roman Ďurikovič, Ph.D., FMFI UK v Bratislave
doc. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., FI MU
doc. Ing. Přemysl Kršek, Ph.D., FIT VUT v Brně
doc. Ing. Jiří Sochor, CSc., FI MU
Reviewers doc. RNDr. Roman Ďurikovič, Ph.D., FMFI UK v Bratislave
doc. Ing. Přemysl Kršek, Ph.D., FIT VUT v Brně
Date of Defence 21. 12. 2011

RNDr. Vojtěch Krmíček

Field of StudyInformatics
Doctoral Thesis Hardware-Accelerated Anomaly Detection in High-Speed Networks
Supervisor prof. Ing. Václav Přenosil, CSc., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Antonín Kučera, Ph.D., FI MU (Chairman)
doc. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., FI MU
Ing. Petr Matoušek, Ph.D., FIT VUT v Brně
prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU
Assoc. Prof. Aiko Pras, University of Twente
prof. Ing. Václav Přenosil, CSc., FI MU
prof. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D., FIT VUT v Brně
Reviewers Ing. Petr Matoušek, Ph.D., FIT VUT v Brně
Assoc. Prof. Aiko Pras, University of Twente
Date of Defence 19. 12. 2011

RNDr. Dalibor Klusáček

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Event-based Optimization of Schedules for Grid Jobs
Supervisor prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU
Consultant doc. Mgr. Hana Rudová, Ph.D., FI MU
Committee Members prof. Ing. Pavel Zezula, CSc., FI MU (Chairman)
doc. RNDr. Roman Barták, Ph.D., MFF UK v Praze
doc. RNDr. Petr Hliněný, Ph.D., FI MU
prof. RNDr. Mojmír Křetínský, CSc., FI MU
prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU
prof. Ing. Miroslav Švéda, FIT VUT v Brně
Reviewers doc. RNDr. Roman Barták, Ph.D., MFF UK v Praze
Prof. Dr. Ramin Yahyapour, University of Dortmund
Date of Defence 25. 10. 2011

RNDr. Radim Řehůřek

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Scalability of Semantic Analysis in Natural Language Processing
Supervisor doc. PhDr. Karel Pala, CSc., FI MU
Consultant doc. RNDr. Petr Sojka, Ph.D., FI MU
Committee Members prof. Ing. Pavel Zezula, CSc., FI MU (Chairman)
prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., FI MU
prof. RNDr. Milan Češka, CSc., FIT VUT v Brně
doc. PhDr. Karel Pala, CSc., FI MU
doc. RNDr. Lubomír Popelínský, Ph.D., FI MU
Dr. Martin Rajman, EPFL Lausanne
doc. RNDr. Petr Sojka, Ph.D., FI MU
Reviewers Dr. Johannes Leveling, Dublin City University
Dr. Martin Rajman, EPFL Lausanne
Date of Defence 12. 9. 2011

RNDr. Jan Pomikálek

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Removing Boilerplate and Duplicate Content from Web Corpora
Supervisor doc. PhDr. Karel Pala, CSc., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU (Chairman)
prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., FI MU
doc. RNDr. Ivan Kopeček, CSc., FI MU
doc. PhDr. Karel Pala, CSc., FI MU
doc. RNDr. Pavel Smrž, Ph.D., FIT VUT v Brně
doc. RNDr. Petr Sojka, Ph.D., FI MU
doc. Dr. Ing. Pavel Zemčík, FIT VUT v Brně
Reviewers Dr. Marco Baroni, Univ. of Trento
RNDr. Pavel Pecina, Ph.D., Dublin City University
doc. RNDr. Pavel Smrž, Ph.D., FIT VUT v Brně
Date of Defence 30. 8. 2011

Mgr. Bc. Petra Komárková

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Dynamic Modeling for Service Systems: Innovation-Cooperation Paradigm in Service Systems
Supervisor RNDr. Zdenko Staníček, Ph.D., FI MU
Committee Members prof. Ing. Pavel Zezula, CSc., FI MU (Chairman)
Dr. George Feuerlicht, Univ. of Technology, Sydney
prof. RNDr. Antonín Kučera, Ph.D., FI MU
prof. RNDr. Václav Matyáš, M.Sc., Ph.D., FI MU
RNDr. Zdenko Staníček, Ph.D., FI MU
prof. Ing. Miroslav Švéda, CSc., FIT VUT v Brně
prof. Ing. Jiří Voříšek, CSc., VŠE v Praze
Reviewers Dr. George Feuerlicht, Univ. of Technology, Sydney
prof. Ing. Jiří Voříšek, CSc., VŠE v Praze
Date of Defence 18. 8. 2011

RNDr. Tomáš Gregar

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Semantics Visualization and Visual Semantics: in E-learning and other Applications
Supervisor doc. RNDr. Tomáš Pitner, Ph.D., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Antonín Kučera, Ph.D., FI MU (Chairman)
prof. RNDr. Ivana Černá, CSc., FI MU
prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU
doc. RNDr. Tomáš Pitner, Ph.D., FI MU
doc. Ing. Jiří Sochor, CSc., FI MU
doc. Ing. Vojtěch Svátek, Dr., VŠE v Praze
doc. Ing. Petr Tůma, Dr., MFF UK v Praze
Reviewersdoc. Ing. Vojtěch Svátek, Dr., VŠE v Praze
doc. Ing. Petr Tůma, Dr., MFF UK v Praze
Date of Defence 18. 8. 2011

RNDr. Martin Maška

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Fast Level Set-Like Algorithms in Fluorescence Microscopy
Supervisor doc. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., FI MU
Consultant RNDr. Pavel Matula, Ph.D., FI MU
Committee Members prof. Ing. Pavel Zezula, CSc., FI MU (Chairman)
prof. RNDr. Ivana Černá, CSc., FI MU
doc. RNDr. Eva Hladká, Ph.D., FI MU
doc. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., FI MU
Ing. Jan Kybic, Ph.D., FEL ČVUT v Praze
doc. Dr. Ing. Pavel Zemčík, FIT VUT v Brně
Reviewers Prof. Gilles Brassard, University of Montreal
Ing. Jan Kybic, Ph.D., FEL ČVUT v Praze
doc. Dr. Ing. Pavel Zemčík, FIT VUT v Brně
Date of Defence 30. 6. 2011

RNDr. Ivan Fialík

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Pseudo-Telepathy Games
Supervisor prof. RNDr. Jozef Gruska, CSc., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Mojmír Křetínský, CSc., FI MU (Chairman)
Ao. Univ.-Prof. Dr. Caslav Brukner, University of Vienna
prof. RNDr. Jozef Gruska, CSc., FI MU
doc. RNDr. Petr Hliněný, Ph.D., FI MU
prof. Ing. Václav Přenosil CSc., FI MU
doc. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D., FIT VUT v Brně
Reviewers Prof. Gilles Brassard, University of Montreal
Ao. Univ.-Prof. Dr. Caslav Brukner, University of Vienna
Prof. Guruprasad Kar, Indian Statistical Institute, Kolkata
Date of Defence 21. 6. 2011

RNDr. Jakub Chaloupka

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Algorithms for Mean-Payoff and Energy Games
Supervisor prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU (Chairman)
prof. RNDr. Luboš Brim, CSc., FI MU
prof. RNDr. Petr Jančar, CSc., FEI VŠB-TU Ostrava
doc. RNDr. Ivan Kopeček, CSc., FI MU
prof. RNDr. Antonín Kučera, Ph.D., FI MU
Prof. Jean-Francois Raskin, Université Libre de Bruxelles
doc. Ing. Tomáš Vojnar, Ph.D., FIT VUT v Brně
Reviewers prof. RNDr. Petr Jančar, CSc., FEI VŠB-TU Ostrava
Prof. Jean-Francois Raskin, Université Libre de Bruxelles
Date of Defence 17. 6. 2011

RNDr. Petr Beneš

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Computation and analysis of channels in protein dynamics
Supervisor doc. Ing. Jiří Sochor, CSc., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Antonín Kučera, Ph.D., FI MU (Chairman)
doc. RNDr. Petr Hliněný, Ph.D., FI MU
prof. Dr. Ing. Ivana Kolingerová, ZČU v Plzni
doc. Ing. Přemysl Kršek, Ph.D., FIT VUT v Brně
prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU
doc. Ing. Jiří Sochor, CSc., FI MU
prof. Ing. Jiří Žára, CSc., FEL ČVUT v Praze
ReviewersProf. Eduard Gröller, Technical University, Vienna
prof. Dr. Ing. Ivana Kolingerová, ZČU v Plzni
Date of Defence 6. 6. 2011

Mgr. Pavel Drášil

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis System Integration in Web 2.0 Environment
Supervisor doc. RNDr. Tomáš Pitner, Ph.D., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Ivana Černá, CSc., FI MU (Chairwoman)
prof. Ing. Jan M. Honzík, CSc., FIT VUT v Brně
prof. RNDr. Václav Matyáš, M.Sc., Ph.D., FI MU
doc. RNDr. Václav Račanský, CSc., ÚVT MU
doc. RNDr. Tomáš Pitner, Ph.D., FI MU
doc. Ing. Jiří Sochor, CSc., FI MU
doc. Ing. Petr Tůma, Dr., MFF UK v Praze
ReviewersMgr. Ing. Lukáš Rychnovský, Ph.D., ÚVT MU
Prof. Ioan Salomie, Ph.D., TU Cluj, Rumunsko
doc. Ing. Petr Tůma, Dr., MFF UK v Praze
Date of Defence 2. 6. 2011

RNDr. Vladimír Ulman

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Fast Anisotropic Filtering and Performance Evaluation Tool for Optical Flow in Biomedical Image Analysis
Supervisor doc. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU (Chairman)
doc. Ing. Radim Kolář, Ph.D., FEKT VUT v Brně
doc. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., FI MU
prof. RNDr. Mojmír Křetínský, CSc., FI MU
prof. Ing. Mirko Navara, DrSc., FEL ČVUT v Praze
doc. Ing. Jiří Sochor, CSc., FI MU
Reviewersdoc. Ing. Radim Kolář, Ph.D., FEKT VUT v Brně
Dr. Stefan Wörz , University of Heidelberg
Date of Defence 25. 2. 2011

RNDr. Mgr. Silvie Luisa Brázdilová

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Information content analysis in automated flourescence microscopy
Supervisor doc. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU (Chairman)
Assoc. Prof. Arrate Munoz Barrutia, Ph.D., University of Navarra, Spain
doc. RNDr. Petr Hliněný, Ph.D., FI MU
doc. RNDr. Radim Chmelík, Ph.D., FSI VUT v Brně
doc. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., FI MU
doc. Ing. Lukáš Sekanina, Ph.D., FIT VUT v Brně
doc. Ing. Jiří Sochor, CSc., FI MU
ReviewersAssoc. Prof. Arrate Munoz Barrutia, Ph.D., University of Navarra, Spain
doc. RNDr. Radim Chmelík, Ph.D., FSI VUT v Brně
Date of Defence 9. 2. 2011

RNDr. Jan Sedmidubský

Field of Study Informatics
Doctoral Thesis Self-organizing Similarity Search The Social Network Approach
Supervisor prof. Ing. Pavel Zezula, CSc., FI MU
Consultant RNDr. Vlastislav Dohnal, Ph.D., FI MU
Committee Members prof. RNDr. Mojmír Křetínský, CSc., FI MU (Chairman)
prof. RNDr. Václav Matyáš, M.Sc., Ph.D., FI MU
prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU
prof. Marco Patella, Ph.D., University of Bologna
doc. RNDr. Tomáš Skopal, Ph.D., MFF UK v Praze
doc. RNDr. Pavel Smrž, Ph.D., FIT VUT v Brně
prof. Ing. Pavel Zezula, CSc., FI MU
Reviewersprof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., FI MU
prof. Marco Patella, Ph.D., University of Bologna
Date of Defence 12. 1. 2011